真言宗智山派来振寺は山号を寳雲山と号し、霊亀元年（七一五）行基菩薩により法相宗真福寺として開山された。神亀二年（七二五）六月十八日、寺の裏山である白山に黄金色の雪が降り積もり（黄金色の雪は加賀の白山権現菊理媛神天下る）、これを伝え効いた聖武天皇の勅号により来振寺と改称する。承平七年（九三七）真言宗に改宗した。　

　白山は石灰岩でできていたので、山全体が白く神々しくみえたことと思われます。おそらくは白山を神としてまつる古代からの信仰があり、仏教の広がりの中で神と仏を同じとみなす考え(神仏習合＝しんぶつしゅうごう)によって神宮寺(じんぐうじ)を建てたのが来振寺のはじまりと思われます。昭和の初めまで山頂の来振神社で雨ごいが行われました。このとき神社の前で祈祷(きとう)を行ったのは来振寺の住職だったことは、神社と寺とのかかわりのなごりかもしれません。
　のちに加賀白山を中心とする白山信仰がさかんになるに連れて、山の白さが尊ばれ、白山を遠くから仰ぎ見る(遙拝)ための山の一つとして位置づけられて「白山」と呼ばれるようになったのではないでしょうか。


　中世には、多くの僧兵を二百数十名有する大寺院だったと伝えられています。鎌倉時代の初めに、美濃国守護の梶原景時が祈願に訪れた。
　この後、寺は不遇うに見舞われる享禄三年（一五三〇）根尾川の大洪水により寺領を流失、また永禄三年（一五六〇）には織田信長の兵火により七堂伽藍相貌を消失し、二百数十名の僧兵が離散する憂き目にあう。
　しかし慶長・元和年間、豊臣秀吉・徳川家康の朱印状を受け寺領を得て再興。宝永六年（一七〇九）には、当山出身の儀山僧正が智山だい十二世管長就任にあたり、現本尊の十一面観音を当山に寄進、また各堂宇を中興した。

　昭和四〇年（一九七二）大師堂、どう五六年（一九八一）本堂、同六〇年（一九八五）には山門をそれぞれ再建し、着々と境内を整備した。
　寺宝の五大尊像（不動明王・降三世明王・軍荼利明王・大威徳明王・烏蒭沙摩明王の五幅）は、国指定重要文化財に指定されてから三十年を経た平成十六年（二〇〇四年に国宝に格上げとなった。
原図は奈良国立博物館に寄託しているため、毎年十一月に同寺大師堂内で御分身（複製の軸）が御開帳される。境内には榧（かや）・椿・銀杏の大木が多数自生する（町の天然記念物）。